BIOS-ParallelBlast: Paralelización optimizada de alineamiento de secuencias sobre Xeon Phi
Resumen El uso de supercomputación en la ciencia es necesario, debido a las grandes cantidades de datos que se analizan para obtener resultados impactantes. Las tecnologías many-core como Intel Xeon Phi aparecen como una alternativa de acelerar estos análisis y su uso en la supercomputación, en especial, dentro de la bioinformática, donde es más común, pero los resultados no son los esperados al ejecutar software altamente demandante en clústeres heterogéneos. En la siguiente investigación se muestra un wrapper encargado de paralelizar óptimamente NCBI-Blast sobre varios nodos de CPUs y Xeon Phi, con el objetivo de reducir al máximo los tiempos de ejecución y demostrar la utilidad que pueden tener las tecnologías many-core en las ciencias aplicadas.
| Main Authors: | , , , , |
|---|---|
| Format: | Digital revista |
| Language: | Spanish / Castilian |
| Published: |
Universidad Nacional Autónoma de México, Facultad de Ingeniería
2017
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| Online Access: | http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-77432017000400423 |
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