Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal.

O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.

Bibliographic Details

Main Authors:	HIGA, R. H., GIACHETTO, P. F., YAMAGISHI, M. E. B., IBELLI, A. M. G., REGITANO, L. C. de A., CARDOSO, F. F.
Other Authors:	ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA; ADRIANA MÉRCIA GUARATINI IBELLI, Bolsista Capes, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE; FERNANDO FLORES CARDOSO, CPPSUL.
Format:	Folhetos biblioteca
Language:	pt_BR por
Published:	2010
Subjects:	Agrupamento de dados, Expressão gênica, Rede Genômica Animal, Análise de componentes principais - PCA, Análise Estatística,
Online Access:	http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/885652
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