Nuclear and plastidial SNP and INDEL markers for genetic tracking studies of Jacaranda copaia

Se desarrollaron marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) e INDEL nucleares y plastidiales utilizando la secuenciación del ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura con fines de genética de poblaciones y seguimiento de la madera en la especie maderera neotropical Jacaranda copaia. Se utilizaron 407 SNPs nucleares, 29 de cloroplasto y 31 de loci mitocondriales para genotipar 92 individuos de Brasil, Bolivia, Guayana Francesa y Perú. Sobre la base de las elevadas tasas de amplificación y la diferenciación genética entre poblaciones, se seleccionaron 113 SNP nucleares, 11 de cloroplasto y 4 loci mitocondriales, y se validó su uso para el seguimiento genético del origen de la madera.

Bibliographic Details

Main Authors:	Sebbenn, Alexandre M., Blanc‑Jolivet, Celine, Mader, Malte, Meyer‑Sand, Barbara, Paredes Villanueva, Kathelyn, Honorio Coronado, Eurídice, García Dávila, Carmen, Tysklind, Niklas, Troispoux, Valerie, Delcamp, Adline, Degen, Bernd
Format:	info:eu-repo/semantics/article biblioteca
Language:	eng
Published:	Springer Nature 2019-05
Subjects:	Jacaranda copaia, Genotipos, Muestreo secuencial, Huellas genéticas ADN, Trazabilidad, Madera tropical, Polimorfismo de un solo nucleótido,
Online Access:	https://hdl.handle.net/20.500.12921/443 https://doi.org/10.1007/s12686-019-01097-9
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