Nuclear and plastidial SNP and INDEL markers for genetic tracking studies of Jacaranda copaia
Se desarrollaron marcadores de polimorfismo de nucleótido único (SNP) e INDEL nucleares y plastidiales utilizando la secuenciación del ADN asociada a la restricción (RADSeq) y la secuenciación del genoma MiSeq de baja cobertura con fines de genética de poblaciones y seguimiento de la madera en la especie maderera neotropical Jacaranda copaia. Se utilizaron 407 SNPs nucleares, 29 de cloroplasto y 31 de loci mitocondriales para genotipar 92 individuos de Brasil, Bolivia, Guayana Francesa y Perú. Sobre la base de las elevadas tasas de amplificación y la diferenciación genética entre poblaciones, se seleccionaron 113 SNP nucleares, 11 de cloroplasto y 4 loci mitocondriales, y se validó su uso para el seguimiento genético del origen de la madera.
Main Authors: | , , , , , , , , , , |
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Format: | info:eu-repo/semantics/article biblioteca |
Language: | eng |
Published: |
Springer Nature
2019-05
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Subjects: | Jacaranda copaia, Genotipos, Muestreo secuencial, Huellas genéticas ADN, Trazabilidad, Madera tropical, Polimorfismo de un solo nucleótido, |
Online Access: | https://hdl.handle.net/20.500.12921/443 https://doi.org/10.1007/s12686-019-01097-9 |
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