Validação de marcadores microssatélites e diversidade genética de genótipos de Coffea arabica provenientes da Etiópia

O café é uma valiosa commodity agrícola, sendo sua bebida uma das mais populares do mundo. Apesar do sucesso dos programas de melhoramento em Coffea arabica, o desenvolvimento de novas cultivares é demorado, podendo levar mais de 20 anos. Além disso, a estreita base genética de C. arabica pode dificultar a obtenção de cultivares resistentes a pragas e a doenças ou tolerantes a estresses abióticos. Os acessos selvagens de C. arabica geneticamente distantes das variedades cultivadas proporcionam novos alelos para enriquecer sua variabilidade genética. O objetivo deste trabalho foi validar marcadores moleculares do tipo SSR em um painel de 24 acessos de C. arabica da coleção da Etiópia, realizar um estudo da diversidade, estrutura e seleção de genótipos para futuros trabalhos de introgressão no melhoramento. Neste trabalho foram utilizados 58 marcadores microssatélites (SSR) obtidos de análises in silico a partir de dados de RNA-seq da cultivar Iapar 59 e de sequências de BACs de Hibrido de Timor 832/2, e 77 SSR obtidos de uma extensa revisão bibliográfica em C. arabica e/ou C. canephora. Dos 135 SSR utilizados, 122 resultaram em produtos de amplificação e 31 foram polimórficos no painel. Desses, 20 SSR foram altamente informativos com valores de PIC acima de 0,7, e sete são descritos pela primeira vez. Um total de 165 alelos foram obtidos com média de 5,3 alelos por loco. O estudo de diversidade e estrutura genética dos acessos separou os genótipos em três principais grupos. A utilização de marcadores SSR informativos assim como o estudo de diversidade e estrutura genética destes e dos demais acessos permitirá a criação de uma coleção nuclear, facilitando a conservação, acessibilidade e uso de recursos genéticos de cafeeiros da Etiópia.

Bibliographic Details

Main Authors:	Rodrigues da Silva, Bruna Silvestre, Bellodi Gação, Sandra, Vecchia Ferreira, Rafaelle, Aparecida Santos, Maria, Ivamoto, Suzana Tiemi, Costa Silva, Juliana, Androcioli Filho, Armando, Silva Domingues, Douglas, Leroy, Thierry, Charmetant, Pierre, Sera, Gustavo, Protasio Pereira, Luiz Filipe
Format:	conference_item biblioteca
Language:	por
Published:	Consórcio Pesquisa Café
Subjects:	F30 - Génétique et amélioration des plantes, F70 - Taxonomie végétale et phytogéographie, U30 - Méthodes de recherche,
Online Access:	http://agritrop.cirad.fr/576599/ http://agritrop.cirad.fr/576599/1/576599.pdf
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