Typologie des pratiques agricoles sur solanacées et diversité génétique de Ralstonia solanacearum, agent causal du flétrissement bactérien en Guyane
L'agent R. solanacearum est une bactérie pathogène du sol qui cause la maladie du flétrissement bactérien. La diversité de l'espèce R. solanacearum est grande et très plastique. On regroupe les souches à caractéristiques génétiques semblables dans des catégories appelées phylotype, elle-même subdivisées en séquévar. En Guyane, les dégâts causés par l'agent R. solanacearum sont d'autant plus graves que le climat, chaud, pluvieux et humide est propice au développement et à la propagation de la bactérie. Le problème récurrent du flétrissement bactérien semble être l'obstacle majeur à l'essor de ces cultures en plein champ. Ainsi, l'un des objectifs du stage est de diagnostiquer le danger inhérent aux pratiques agricoles des exploitants cultivant des tomates, aubergines ou poivrons (TAP). D'autre part, on cherche à approfondir les connaissances génétiques sur la population de l'agent R. solanacearum de Guyane. En effet, cela renseignera notamment sur le degré d'importance de l'implantation des souches de phylotype IIB séquévar 4NPB en Guyane. Enfin, le dernier volet du stage consiste en deux essais : l'un pour tester les effets de la méthode de solarisation du sol comme moyen de limitation de l'incidence de la maladie, l'autre consiste en un criblage variétal. La sensibilité de plusieurs variétés est testée face moyen de l'inoculation artificielle de 3 souches de l'agent R. solanacearum de phylotypes différents. On choisit de questionner un échantillon réduit d'agriculteurs de TAP répartis dans les 3 bassins maraichers les plus importants du littoral guyanais. Cette étape permet de récupérer les données sur les pratiques agricoles. En parallèles le travail d'échantillonnage de souches est mené. On cherche à collecter une dizaine de souches par exploitation pour les trois espèces dans chaque bassin maraicher. La typologie des groupes d'agriculteurs est réalisée grâce au classement des itinéraires techniques selon l'évaluation du danger que représentent certaines pratiques culturales. Le phylotypage permet de connaître les différents séquévars et phylotypes retrouvés en Guyane. Enfin, les expériences de criblage variétal et de solarisation sont mises en place en prenant en compte les contraintes de terrain. Des variables comme le taux de flétrissement, sont relevées afin de pouvoir interpréter l'impact des différents traitements des essais. Grâce au phylotypage des souches on sait maintenant que le séquévar émergent, très agressif, est bien implanté en Guyane. L'étude a renseigné également sur la distribution géographique des autres phylotypes et a confirmé l'impact des précédents culturaux sur la nature génétique de la population de l'agent R. solanacearum présente sur les cultures. L'expérience de criblage variétal permet d'identifier certaines variétés comme plus résistantes que d'autres. Cependant, il est impératif de répéter l'expérience pour confirmer ces résultats. L'expérience de solarisation montre que la pose de plastique sur le sol même non traité antiuv permet une hausse significative des températures du sol. Néanmoins, on ne sait toujours pas si cela suffira pour diminuer l'incidence de la maladie. En effet, l'expérience est toujours en cours. Enfin, la typologie des itinéraires techniques répartit les exploitations dans 5 groupes du plus risqué aux moins risqué. Près de la moitié des agriculteurs de l'échantillon se situe dans les 2 catégories les plus risquées. Le travail de typologie peut être amélioré en y ajoutant notamment des variables environnementales. Ce travail compile des données qui trouveront une autre utilité dans la mise en place future du plan de réduction d'utilisation des phytosanitaires en Guyane (ecophyto 2018).
| Main Author: | |
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| Format: | thesis biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
AgroParisTech
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| Subjects: | H20 - Maladies des plantes, F08 - Systèmes et modes de culture, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/570536/ http://agritrop.cirad.fr/570536/1/document_570536.pdf |
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