Marche vers un gène de résistance chez la canne à sucre, exploitation des ressources BAC canne, riz et sorgho

Les cultivars de canne à sucre Saccharum spp (2n = 100 à 130) appartiennent à la famille des Poacées au même titre que le riz ou le sorgho et présentent un génome complexe hautement polyploide et aneuploide. Un gène majeur, conférant la résistance à la rouille dont l'agent pathogène est le champignon Puccinia melanocephala, a été identifié chez le cultivar R570. Ce gène a été cartographié, les marqueurs les plus proches se situent à 2 cM de chaque côté du gène. L'objectif à terme est le clonage positionnel de ce gène. Dans un premier temps, notre objectif est de se rapprocher du gène en utilisant les différentes ressources BAC : la banque BAC de R570, une banque BAC de riz et une banque BAC de sorgho. Deux contigs de canne situés de chaque côté du gène ont été construits. Leur extension est ralentie par la présence de séquences répétées. L'identification de marqueurs ou sous-clones de BAC canne s'hybridant avec le riz et le sorgho a permis d'identifier des contigs de BAC de ces deux espèces de chaque côté du gène. Les banques BAC de ces deux espèces sont partiellement contiguées ce qui devrait permettre, si la micro-synténie est conservée dans cette région, d'accélérer la marche vers le gène. L'exploitation des BAC riz est ralentie par le faible taux d'hybridations croisées observé. L'exploitation des BAC sorgho semble plus prometeuse pour la suite du projet.

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Bibliographic Details
Main Author: Collot, Jean Marc
Format: thesis biblioteca
Language:fre
Published: Université de Paris VII
Subjects:F30 - Génétique et amélioration des plantes, H20 - Maladies des plantes,
Online Access:http://agritrop.cirad.fr/477024/
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