Diversité de Ralstonia solanacearum par analyse PCR-RFLP de la zone des gènes hrp
Le flétrissement bactérien, dont l'agent causal est #Ralstonia solanacearum#, est une maladie vasculaire d'origine tellurique qui atteint plus de 200 espèces représentant 50 familles botaniques. Cette maladie est implantée sur les cinq continents et provoque dans la plupart des pays tropicaux, subtropicaux ou tempérés chauds de sérieux dégâts sur des cultures de grand intérêt économique (tomate, pomme de terre, banane). Sa large distribution géographique et la nature des dégâts engendrés la classent parmi les agents pathogènes les plus importants économiquement. #R. solanacearum# est une espèce bactérienne qui manifeste une très grande variabilité dans ses isolats aussi bien au niveau pathologique que physiologique, sérologique ou génétique. Actuellement, les subdivisions de l'espèce en races, en biovars et en groupes WLP sont utilisées pour caractériser les souches de #R. solanacearum#. L'objectif de notre étude était d'analyser cette diversité en utilisant une technique relativement simple et rapide, la PCR/RFLP. La démarche a consisté à explorer l'ensemble de la zone des gènes hrp en sélectionnant 11 couples d'amorces. La spécificité pour 6 des séquences amplifiées a été vérifiée. Il reste néanmoins à confirmer cette spécificité par l'utilisation de souches de deux espèces très proches de #R. solanacearum#, #Pseudomonas syzygii# et #P. celebense#. La digestion des fragments amplifiés par des endonudéases de restriction a permis de mettre en évidence au sein de l'espèce #R. solanacearum# (125 souches d'origines géographiques diverses) une très grande variabilité au sein des souches de biovar 1, à un degré moindre pour celles de biovar 3, et une plus grande homogénéité de celles de biovar 2. Plusieurs groupes PCR/RFLP ont ainsi été définis.
| Main Authors: | , , |
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| Format: | conference_item biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
INRA
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| Subjects: | H20 - Maladies des plantes, F30 - Génétique et amélioration des plantes, flétrissement, maladie bactérienne, variation génétique, PCR, RFLP, Geminiviridae, Ralstonia solanacearum, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_8391, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_770, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15975, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34079, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_34255, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_32859, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_37076, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/465188/ |
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