Aspects statistiques de la cartographie des marqueurs moléculaires
Ce document aborde un certain nombre de problèmes statistiques rencontrés en cartographie génétique. Plusieurs points sont discutés : les méthodes de détection et d'estimation de la liaison entre marqueurs; l'ordonnancement des marqueurs par analyse multipoint, avec présentation de quelques logiciels de cartographie; les fonctions de cartographie de Haldane et de Kosambi, qui ont pour but de transformer des fréquences de recombinaison en distances de carte additives; les intérêts particuliers de différents types de populations en ségrégation (backcross, F2, lignées recombinantes, haploïdes doublés) pour la cartographie; ces populations sont comparées en termes de précision d'estimation des fréquences de recombinaison entre marqueurs; l'influence de la taille des populations utilisées; l'estimation du nombre de marqueurs à utiliser pour que la carte soit saturée (i.e., qu'il n'y ait pas d'espace sans marqueur de plus de x centimorgans) avec une probabilité donnée; l'estimation de la taille du génome en centimorgans (méthode de Hubert et al., 1988)
| Main Author: | |
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| Format: | monograph biblioteca |
| Language: | fre |
| Published: |
CIRAD
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| Subjects: | F30 - Génétique et amélioration des plantes, U10 - Informatique, mathématiques et statistiques, méthode statistique, marqueur génétique, carte génétique, génome, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7377, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24030, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_24002, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_3224, |
| Online Access: | http://agritrop.cirad.fr/326546/ http://agritrop.cirad.fr/326546/1/ID326546.pdf |
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