Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim.
Resumo: Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados para então serem utilizados para seleção assistida por marcadores moleculares.
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Published: |
2013-01-29
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Subjects: | Área de olho de lombo, Bovino de corte, Espessura de gordura subcutânea, Random forest, Ribeye area, Backfat, Single nucleotide polymorphism, Beef cattle, |
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dig-alice-doc-9467292017-08-15T22:39:29Z Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim. MOKRY, F. B. LIMA, A. O. de URBINATI, I. TORRES JUNIOR, R. A. de A. HIGA, R. H. REGITANO, L. C. de A. FABIANA BARICHELLO MOKRY, UFSCar; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, UFSCar; ISMAEL URBINATI; ROBERTO AUGUSTO DE ALMEIDA TORRES JÚNIOR, CNPGC; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. Área de olho de lombo Bovino de corte Espessura de gordura subcutânea Random forest Ribeye area Backfat Single nucleotide polymorphism Beef cattle Resumo: Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados para então serem utilizados para seleção assistida por marcadores moleculares. SBMA 2012. 2013-01-29T11:11:11Z 2013-01-29T11:11:11Z 2013-01-29 2012 2020-01-22T11:11:11Z Anais e Proceedings de eventos In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946729 pt_BR por openAccess Não paginado. |
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Resumo: Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados para então serem utilizados para seleção assistida por marcadores moleculares. |
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