Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim.

Resumo: Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados para então serem utilizados para seleção assistida por marcadores moleculares.

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Bibliographic Details
Main Authors: MOKRY, F. B., LIMA, A. O. de, URBINATI, I., TORRES JUNIOR, R. A. de A., HIGA, R. H., REGITANO, L. C. de A.
Other Authors: FABIANA BARICHELLO MOKRY, UFSCar; ANDRESSA OLIVEIRA DE LIMA, UFSCar; ISMAEL URBINATI; ROBERTO AUGUSTO DE ALMEIDA TORRES JÚNIOR, CNPGC; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Format: Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:pt_BR
por
Published: 2013-01-29
Subjects:Área de olho de lombo, Bovino de corte, Espessura de gordura subcutânea, Random forest, Ribeye area, Backfat, Single nucleotide polymorphism, Beef cattle,
Online Access:http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946729
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