Estudo de associação genômica ampla para importantes características agronômicas em Coffea canephora.

RESUMO: O Estudo de Associação Genômica Ampla (Genome-Wide Association Studies ? GWAS) surgiu com o intuito de capturar o efeito de genes na determinação de determinada característica fenotípica. Para isso, os indivíduos selecionados são genotipados em escala genômica e fenotipados para as características de interesse e então, a partir de análises estatísticas entre os polimorfismos de DNA e a variação no fenótipo, os genes que controlam essas características podem ser identificados. Por se tratar de uma espécie perene e de ciclo longo, os programas de melhoramento genético convencional do cafeeiro são demorados (vários anos) e de custo elevado. A geração de cultivares superiores via melhoramento genético ainda lida com o desafio de agregar simultaneamente diversas características quantitativas de relevância agronômica, assim como a qualidade de bebida. Neste contexto, na tentativa de identificar genes/regiões genômicas associadas à características agronômicas importantes, 1.319 indivíduos da Embrapa Cerrados foram genotipados e fenotipados, e posteriormente, realizou-se um estudo de GWAS com os softwares TASSEL e rrBLUP. Um número diferente de marcadores associados foi identificado com as duas estratégias utilizadas. Foram identificados marcadores tanto em regiões intergênicas como em regiões gênicas, sendo que, nesta última, os marcadores estavam presentes em genes já caracterizados e descritos na literatura para outras espécies como estando relacionados às características agronômicas aqui analisadas.

Bibliographic Details

Main Authors:	CARNEIRO, F. de A., AQUINO, S. O. de, MATTOS, N. G., VALERIANO, J. C., CARNEIRO, W. W. de J., RODRIGUES, G. C., CARVALHO, M. A. de F., VEIGA, A. D., GRATTAPAGLIA, D., SILVA JUNIOR, O. B. da, MARRACCINI, P., VIEIRA JUNIOR, I. C., BALESTRE, M., ANDRADE, A. C.
Other Authors:	FERNANDA DE ARAÚJO CARNEIRO, Ufla; SINARA OLIVEIRA DE AQUINO, Ufla; NATHÁLIA GOMES MATTOS, Ufla; JÉSSICA COELHO VALERIANO, Ufla; WENDEL WILLIAM DE JESUS CARNEIRO, Bolsista Consórcio Pesquisa Café; GUSTAVO COSTA RODRIGUES, CNPTIA; MILENE ALVES DE FIGUEIREDO CARVALHO, CNPCa; ADRIANO DELLY VEIGA, CPAC; DARIO GRATTAPAGLIA, Cenargen; ORZENIL BONFIM DA SILVA JUNIOR, Cenargen; PIERRE MARRACCINI, Cirad; INDALECIO CUNHA VIEIRA JUNIOR, Ufla; MARCIO BALESTRE, Ufla; ALAN CARVALHO ANDRADE, CNPCa.
Format:	Anais e Proceedings de eventos biblioteca
Language:	pt_BR pt_BR
Published:	2019-11-12
Subjects:	Diversidade genética, Nucleotídeo de polimorfismo único, Genome Wide Association Studies, Genetic diversity, Café, Coffea Canephora, Single nucleotide polymorphism,
Online Access:	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114202
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