Estudo da diversidade genética de populações naturais de açaizeiro (Euterpe precatoria Mart.).
Entre os recursos genéticos da Amazônia, o açaizeiro, Euterpe precatoria, destaca-se em função do valor agronômico, econômico, social e cultural associado principalmente a extração e comercialização da polpa do açaí. A caracterização genética de populações naturais poderá auxiliar no desenvolvimento e recomendação de práticas de manejo e estratégias adequadas de conservação da espécie. Os objetivos deste estudo foram avaliar métodos de preservação e maceração de folíolos de E. precatoria para a obtenção de DNA; testar a transferibilidade de microssatélites de E. edulis para E. precatoria e avaliar a diversidade e estrutura genética espacial (EGE) de populações de E. precatoria em floresta de terra firme e baixio. Foram testados 12 tratamentos de armazenamento e dois tipos de maceração. Analisou-se 18 microssatélites desenvolvidos para E. edulis em 20 indivíduos de duas populações de E. precatoria (Formoso e Novo Segredo). Foram coletados folíolos de 92 indivíduos de população de açaizeiro em terra firme (Formoso) e 96 indivíduos em área de baixio (Novo Segredo) no município de Feijó, AC. Verificou-se interação entre armazenamento e tipo de maceração, quando os folíolos foram macerados com nitrogênio líquido, sendo que as concentrações de DNA variaram de 285,00 ng/uL (7 dias em tampão de transporte) a 702,00 ng/uL (30 dias em sílica gel). Quando maceradas com TissueLyser® variaram de 572,73 ng/uL (30 dias em sílica gel) a 2.850,00 ng/uL (3 dias em liofilizador). A pureza do DNA (A260/A280 nm) variou de 1,30 a 1,70 quando os folíolos foram macerados com nitrogênio líquido e de 1,30 a 1,90 com o uso do TissueLyser®. No estudo de transferibilidade observou-se que nove locos foram polimórficos, com 29 alelos na população Formoso e 27 alelos na Novo Segredo. Na população Formoso e Novo Segredo foram observados os valores médios da heterozigosidade esperada de 0,421 e 0,418 e a observada de 0,333 e 0,267, respectivamente. Para o estudo de diversidade e EGE observou-se um total de 45 alelos, nos 188 indivíduos coletados e genotipados com nove locos microssatélites. Foram observados baixos valores médios de heterozigosidade esperada (0,330) e observada (0,270). É possível sugerir que o baixo polimorfismo observado esteja associado ao uso de locos heterólogos. Foi detectada ausência de endogamia ( F ), o que mostra excesso de heterozigotos. A divergência genética (???) entre as populações foi alta e significativa, sendo que 27% da variabilidade esteve entre as populações e 73% dentro. As análises de agrupamentos alocaram os indivíduos de acordo com o local em que foram coletados, formando dois grupos. A análise de EGE aponta que a coletas de sementes para conservação da espécie E. precatoria não deve ocorrer entre palmeiras distantes a menos de 50 m em área de baixio e 78 m em área de terra firme, a fim de evitar a coleta de sementes entre indivíduos aparentados. A coleção nuclear identificada foi composta por nove palmeiras na área de baixio e 12 em área de terra firme. A conservação in situ da coleção nuclear é uma estratégia relevante que objetiva conservar a diversidade genética de toda a população, e também preserva os habitats onde a espécie ocorre. Conclui-se que todos os tratamentos de armazenamento e maceração foram eficazes para o isolamento do DNA genômico. Nove microssatélites foram transferíveis e polimórficos. As populações de E. precatoria estudadas (Terra Firme e Baixio) apresentaram diferenciação genética entre e dentre as populações. A definição da coleção nuclear, juntamente com a coancestria são análises robustas e que podem ser utilizadas em conjunto para a elaboração de estratégias de conservação in e ex situ de E. precatoria. Among the genetic resources in the Amazon, açaizeiro, Euterpe precatoria, stands out due to the agronomic, economic, social and cultural values associated with the extraction and commercialization of açaí pulp. The genetic characterization of natural populations may help in the development and recommendation of management practices and appropriate conservation strategies of the species. The objectives of this study were to evaluate methods of preservation and maceration of E. precatoria leaflets to obtain DNA; to test the transferability of E. edulis microsatellites to E. precatoria and to evaluate the diversity and spatial genetic structure (SGS) of E. precatoria populations in dryland and flooded forests. Twelve storage treatments and two types of maceration were tested. It was analyzed 18 microsatellites developed for E. edulis in 20 individuals of two E. precatoria (Formoso and Novo Segredo) populations. Leaflets were collected from 92 individuals of açaizeiro population on dryland (Formoso) and 96 individuals in flooded area (Novo Segredo) in the municipality of Feijó, state of Acre. An interaction was found between storage and maceration type when leaflets were macerated with liquid nitrogen, and DNA concentrations ranged from 285.00 ng/uL (7 days in transport buffer) to 702.00 ng/uL ( 30 days on silica gel). When macerated with TissueLyser® ranged from 572.73 ng/uL (30 days on silica gel) to 2,850.00 ng/uL (3 days in lyophilizer). The DNA purity (A260/A280 nm) ranged from 1.30 to 1.70 when the leaflets were macerated with liquid nitrogen and from 1.30 to 1.90 with the use of TissueLyser®. It was observed in the transferability study that nine loci were polymorphic, with 29 and 27 alleles in the Formoso and Novo Segredo populations, respectively. The average values of expected heterozygosity were 0.421 and 0.418 and observed values of 0.333 and 0.267 for Formoso and Novo Segredo populations, respectively. For the study of diversity and SGS, a total of 45 alleles were observed in 188 individuals collected and genotyped with nine microsatellite loci. It was also observed low average values of expected (0.330) and observed (0.270) heterozygosity. It is possible to suggest that the low polymorphism observed is associated with the use of heterologous loci. The lack of inbreeding ( F ) shows excess of heterozygotes. The genetic divergence (???) among the populations was high and significant, where 27% of the variability was found between the populations and 73% within. The cluster analyzes allocated the individuals according to the place where they were collected, forming two sets. The SGS analysis indicates that the collection of seeds for E. precatoria conservation should not occur between palm trees at less than 50 m of distance in flooded area and 78 m in dryland, in order to avoid the collection of seeds among related individuals. The identified nuclear collection was composed by nine palm trees in the flooded area and 12 in the dryland area. The in situ conservation of the nuclear collection is a relevant strategy whose goal is to conserve the genetic diversity of the entire population, and also to preserve the habitats where the species occurs. It was concluded that all storage and maceration treatments were effective for genomic DNA isolation. Nine microsatellites were transferable and polymorphic. The assessed populations of E. precatoria (dryland and flooded) showed genetic differentiation among and within the populations. The definition of the nuclear collection associated with coancestry are robust analyzes that can be used together for the elaboration of in situ and ex situ conservation strategies of E. precatoria.
| Main Author: | |
|---|---|
| Other Authors: | |
| Format: | Teses biblioteca |
| Language: | pt_BR por |
| Published: |
2019-06-06
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| Subjects: | Variación genética, Marcadores genéticos, Repeticiones de microsatélite, Marcador microssatélite, Fitomejoramiento, Açaí, Variação Genética, Marcador Molecular, Melhoramento Genético Vegetal, Euterpe precatoria, Genetic variation, Genetic markers, Microsatellite repeats, Plant breeding, |
| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1109695 |
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