Variabilidad genética y patógenica de Phytophthora cinnamomi Rands en Quercus sp Persea Americana y Pseudotsuga Menziesii.

Variabilidad genética y patógenica de Phytophthora cinnamomi Rands en Quercus sp Persea Americana y Pseudotsuga Menziesii.

Tesis (Doctorado en Ciencias, especialista en Fitopatología).- Colegio de Postgraduados, 2016.

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Main Authors: ALMARAZ SÁNCHEZ, ALEJANDRA; 216590, Almaraz Sánchez, Alejandra
Other Authors: ALVARADO ROSALES, DIONICIO; 56712
Format: Tesis biblioteca
Language:spa
Published: 2016-02
Subjects:Phytophthora cinnamomi, Identificación, Morfológica, Identification, Morphological, Molecular, Microsatelites, Fitopatología, Doctorado, CIENCIAS AGROPECUARIAS Y BIOTECNOLOGÍA::CIENCIAS AGRARIAS::AGRONOMÍA::PARASITOLOGÍA VEGETAL,
Online Access:http://hdl.handle.net/10521/3389
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El objetivo de este trabajo fue identificar morfológica, patogénica y genética de 64 aislamientos de P. cinnamomi, procedentes de cinco regiones de México obtenidos de tres hospedantes con síntomas de la “enfermedad de la tinta”. Los aislamientos se obtuvieron de suelo, cancro y raíz de árboles de Quercus salicifolia., de las regiones de El Arrayanal, Colima; Tecoanapa, Guerrero, Manantlán, Jalisco, de Pseudotsuga mensiezii del Estado de México y de árboles de Persea americana, de Michoacán. La caracterización morfológica de los aislados indicó que las colonias desarrolladas sobre medio PDA presentaron un crecimiento lento, coloración blanca de consistencia algodonosa y aspecto de forma de flor camelia para los aislados de Colima, Guerrero, Jalisco y Edo. de México. La patogenicidad del agente causal se realizó tomando un aislamiento de cada una de las cinco regiones de México, siguiendo los postulados de Koch, con plantas sanas de Quercus mexicana, Persea Americana de seis meses edad y Pseudotsuga menziesii de tres años de edad. Los resultados obtenidos indicaron que los cinco aislamientos de Phytophthora cinnamomi son capaces de causar la enfermedad en plantas. El aislamiento de la región del Arrayanal se comportó como el más virulento en los tres hospedantes. Los 64 aislamientos de Phytophthora fueron identificados como Phytophthora cinnamomi y con un 99 % de similitud en la base de datos del GenBank del CNBI. Para conocer la variabilidad genética de los aislamientos de P. cinnamomi se evaluó a través de Microsatélites (SSR). Se utilizaron cinco primers: d39, e16, g10, g13 (1) y g13(4). Se agregaron 10 aislamientos de otras regiones del mundo de la colección del laboratorio de la Universidad de Berkeley California USA. La distancia genética entre los aislamientos fue calculada por el método de promedios con el programa R (versición;2.10.0). Se formaron cuatro grupos dentro del dendrograma, los aislamientos de P. cinnamomi de los hospedantes de Quercus spp., Pseudotsuga mensiezii y Persea americana de México se encontró similitud con los aislamientos de Papúa Nueva Guinea. El árbol filogenético con los aislamientos de estudio por el método de cálculo de matriz de distancias genéticas; formaron seis clados agrupando la mayoría de los aislamientos de interés con los de Papúa Nueva Guinea. _______________ PATHOGENICITY AND GENÉTIC VARIABILITY OF PHYTOPHTHORA CINNAMOMI IN QUERCUS SPP., PERSEA AMERICANA AND PSEUDOTSUGA MENZIESII. ABSTRACT: Phytophthora cinnamomi (Rands) is a soil microorganism that has caused great economic and ecological losses worldwide, in a wide host range. It is a facultative and aquatic parasite that causes root rot and is able to live in soil for long periods of time. The aim of this study was to identify morphological, genetic and pathogenically 64 isolates of P. cinnamomi collected from five regions of Mexico, on three hosts showing symptoms of the "ink disease". The isolates were obtained from soil, root or stem cankers on the following hosts and locations: Quercus salicifolia, from El Arrayanal, Colima, Tecoanapa, Guerrero and Manantlan, Jalisco; Pseudotsuga menziesii, Estado de Mexico and Persea americana, Michoacan. Morphological characterization of the isolates showed that colonies developed on PDA medium displayed slow growth, white color, cottony consistency and camellia blossom appearance for the Colima, Guerrero, Jalisco and Edo. de Mexico isolates. Pathogenicity tests were carried out with one isolate from each of the five regions of Mexico, following Koch's postulates, on healthy plants of Quercus mexicana and Persea americana six months old, and Pseudotsuga menziesii three years old. The genetic variability of the isolates was assessed by usind the microsatellites (SSR) technique and five primers: d39, e16, g10, g13 (1) and g13 (4). 10 isolates more, from other regions of the world, were added in the analysis. The genetic distance among isolates was calculated by the average method with the R program (version 2.10.0). The results showed that the five isolates of P. cinnamomi were able to cause disease. The isolate from El Arrayanal behaved as the most virulent in the three hosts. The 64 isolates were identified as Phytophthora cinnamomi with 99% of similarity with the GenBank database of the CNBI. Four groups in the dendrogram were identified, P. cinnamomi isolates from Quercus spp., Pseudotsuga menziesii and Persea americana showed similarity with the Papua New Guinea isolates. Regarding the phylogenetic tree analysis, the distance matrix was used to generate a tree, six clades were formed, most of the Mexican isolates were similar to the ones from Papua New Guinea. Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT). 2019-06-07T17:27:36Z 2019-06-07T17:27:36Z 2016-02 Tesis doctoralThesis http://hdl.handle.net/10521/3389 spa http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0 pdf application/pdf

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