Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos.
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h2 = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias, o tamanho das famílias e a proporção da variância genética devida aos QTLs e à posição dos QTLs, localizados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes e não-adjacentes. Os fatores que mais influenciaram as estimativas dos parâmetros foram as proporções da variância devida aos QTLs, ao número e ao tamanho das famílias. As estimativas mais viesadas dos componentes dos QTLs e poligênico foram obtidas com a análise dos registros de somente dez famílias. Com número suficiente de famílias e de indivíduos nas famílias e altas proporções de variância genética devida aos QTLs, o modelo aleatório pode detectar QTL com alto poder, apresentando estimativas das posições com boa acurácia, se não existirem dois QTLs no mesmo intervalo. Para o mapeamento fino e estimativas apropriadas da variância dos QTLs, métodos mais sofisticados devem ser utilizados.
Main Authors: | , , , , , , , |
---|---|
Other Authors: | |
Format: | Artigo de periódico biblioteca |
Language: | Portugues pt_BR |
Published: |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 1, p. 66-75, 2005.
2005-10-11
|
Subjects: | Mapeamento por intervalo, Marcador Genético, |
Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886 https://doi.org/10.1590/S1516-35982005000100009 |
Tags: |
Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
|
id |
dig-alice-doc-594886 |
---|---|
record_format |
koha |
spelling |
dig-alice-doc-5948862023-01-23T21:02:34Z Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. SILVA, M. V. G. B. da MARTINEZ, M. L. TORRES, R. de A. LOPES, P. S. EUCLYDES, R. F. PEREIRA, C. S. MACHADO, M. A. ARBEX, W. CNPGL. Mapeamento por intervalo Marcador Genético O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h2 = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias, o tamanho das famílias e a proporção da variância genética devida aos QTLs e à posição dos QTLs, localizados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes e não-adjacentes. Os fatores que mais influenciaram as estimativas dos parâmetros foram as proporções da variância devida aos QTLs, ao número e ao tamanho das famílias. As estimativas mais viesadas dos componentes dos QTLs e poligênico foram obtidas com a análise dos registros de somente dez famílias. Com número suficiente de famílias e de indivíduos nas famílias e altas proporções de variância genética devida aos QTLs, o modelo aleatório pode detectar QTL com alto poder, apresentando estimativas das posições com boa acurácia, se não existirem dois QTLs no mesmo intervalo. Para o mapeamento fino e estimativas apropriadas da variância dos QTLs, métodos mais sofisticados devem ser utilizados. 2023-01-23T21:02:34Z 2023-01-23T21:02:34Z 2005-10-11 2005 Artigo de periódico http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886 https://doi.org/10.1590/S1516-35982005000100009 Portugues pt_BR openAccess Revista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 1, p. 66-75, 2005. |
institution |
EMBRAPA |
collection |
DSpace |
country |
Brasil |
countrycode |
BR |
component |
Bibliográfico |
access |
En linea |
databasecode |
dig-alice |
tag |
biblioteca |
region |
America del Sur |
libraryname |
Sistema de bibliotecas de EMBRAPA |
language |
Portugues pt_BR |
topic |
Mapeamento por intervalo Marcador Genético Mapeamento por intervalo Marcador Genético |
spellingShingle |
Mapeamento por intervalo Marcador Genético Mapeamento por intervalo Marcador Genético SILVA, M. V. G. B. da MARTINEZ, M. L. TORRES, R. de A. LOPES, P. S. EUCLYDES, R. F. PEREIRA, C. S. MACHADO, M. A. ARBEX, W. Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
description |
O procedimento de mapeamento por intervalo baseado em modelo aleatório foi aplicado para estudar sua robustez e propriedades no mapeamento de dois QTLs, em populações constituídas de famílias de meios-irmãos. Sob o modelo aleatório, a localização e os componentes de variância foram estimados usando o método da máxima verossimilhança. A estimação dos parâmetros foi baseada na metodologia de pares de irmãos. As proporções de genes idênticos por descendência (IBD) dos QTLs foram estimadas a partir das proporções IBD de dois marcadores flanqueadores. As estimativas dos parâmetros dos QTLs (localizações e componentes de variância) e do poder de detecção, em uma característica com h2 = 0,25, foram obtidas usando dados simulados, variando-se o número de famílias, o tamanho das famílias e a proporção da variância genética devida aos QTLs e à posição dos QTLs, localizados no mesmo intervalo, em intervalos adjacentes e não-adjacentes. Os fatores que mais influenciaram as estimativas dos parâmetros foram as proporções da variância devida aos QTLs, ao número e ao tamanho das famílias. As estimativas mais viesadas dos componentes dos QTLs e poligênico foram obtidas com a análise dos registros de somente dez famílias. Com número suficiente de famílias e de indivíduos nas famílias e altas proporções de variância genética devida aos QTLs, o modelo aleatório pode detectar QTL com alto poder, apresentando estimativas das posições com boa acurácia, se não existirem dois QTLs no mesmo intervalo. Para o mapeamento fino e estimativas apropriadas da variância dos QTLs, métodos mais sofisticados devem ser utilizados. |
author2 |
CNPGL. |
author_facet |
CNPGL. SILVA, M. V. G. B. da MARTINEZ, M. L. TORRES, R. de A. LOPES, P. S. EUCLYDES, R. F. PEREIRA, C. S. MACHADO, M. A. ARBEX, W. |
format |
Artigo de periódico |
topic_facet |
Mapeamento por intervalo Marcador Genético |
author |
SILVA, M. V. G. B. da MARTINEZ, M. L. TORRES, R. de A. LOPES, P. S. EUCLYDES, R. F. PEREIRA, C. S. MACHADO, M. A. ARBEX, W. |
author_sort |
SILVA, M. V. G. B. da |
title |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_short |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_full |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_fullStr |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_full_unstemmed |
Modelos aleatórios na estimação da localização de QTLs em famílias de meios-irmãos. |
title_sort |
modelos aleatórios na estimação da localização de qtls em famílias de meios-irmãos. |
publisher |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 34, n. 1, p. 66-75, 2005. |
publishDate |
2005-10-11 |
url |
http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/594886 https://doi.org/10.1590/S1516-35982005000100009 |
work_keys_str_mv |
AT silvamvgbda modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos AT martinezml modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos AT torresrdea modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos AT lopesps modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos AT euclydesrf modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos AT pereiracs modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos AT machadoma modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos AT arbexw modelosaleatoriosnaestimacaodalocalizacaodeqtlsemfamiliasdemeiosirmaos |
_version_ |
1756029011839942656 |