Implementação de 4 métodos de análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes.
No contexto de estudos de associação genômica ampla (GWAS), métodos para a análise de enriquecimento de um conjunto de genes (GSEA) analisam conjuntos de SNPs associados a genes que compartilham mesma função biológica, localização cromossômica ou via regulatória e buscam identificar SNPs que estão relacionados com variações no fenótipo em estudo. Neste trabalho foram implementados quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura (fenótipos quantitativos)
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2015-12-09
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| Online Access: | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1031168 |
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dig-alice-doc-10311682017-08-16T03:22:48Z Implementação de 4 métodos de análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes. GUERREIRO, A. T. HIGA, R. H. ALINE TAISE GUERREIRO, Unicamp, Bolsista CNPq (PIBIC); ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA. Estudos de associação genômica ampla Polimorfismo de nucleotídeo único Modelos lineares mistos Random forests Mixed models Single nucleotide polymorphism Models No contexto de estudos de associação genômica ampla (GWAS), métodos para a análise de enriquecimento de um conjunto de genes (GSEA) analisam conjuntos de SNPs associados a genes que compartilham mesma função biológica, localização cromossômica ou via regulatória e buscam identificar SNPs que estão relacionados com variações no fenótipo em estudo. Neste trabalho foram implementados quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura (fenótipos quantitativos) CIIC 2015. Nº 15604 2015-12-09T11:11:11Z 2015-12-09T11:11:11Z 2015-12-09 2015 2020-01-21T11:11:11Z Anais e Proceedings de eventos In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA, 9., 2015, Campinas. Anais... Campinas: IAC, 2015. http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1031168 pt_BR por openAccess 1 CD-ROM. |
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Estudos de associação genômica ampla Polimorfismo de nucleotídeo único Modelos lineares mistos Random forests Mixed models Single nucleotide polymorphism Models Estudos de associação genômica ampla Polimorfismo de nucleotídeo único Modelos lineares mistos Random forests Mixed models Single nucleotide polymorphism Models GUERREIRO, A. T. HIGA, R. H. Implementação de 4 métodos de análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes. |
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No contexto de estudos de associação genômica ampla (GWAS), métodos para a análise de enriquecimento de um conjunto de genes (GSEA) analisam conjuntos de SNPs associados a genes que compartilham mesma função biológica, localização cromossômica ou via regulatória e buscam identificar SNPs que estão relacionados com variações no fenótipo em estudo. Neste trabalho foram implementados quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura (fenótipos quantitativos) |
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ALINE TAISE GUERREIRO, Unicamp, Bolsista CNPq (PIBIC); ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA. |
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