An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle.

by OLIVEIRA, P. S. N. de, COUTINHO, L. L., TIZIOTO, P. C., CESAR, A. S. M., OLIVEIRA, G. B. de, DINIZ, W, J. da S., LIMA, A. O. de, REECY, J. M., MOURÃO, G. B., ZERLOTINI NETO, A., REGITANO, L. C. de A.
Published 2018-11-21

An integrative transcriptome analysis indicates regulatory mRNA-miRNA networks for residual feed intake in Nelore cattle.

by OLIVEIRA, P. S. N. de, COUTINHO, L. L., TIZIOTO, P. C., CESAR, A. S. M., OLIVEIRA, G. B. de, DINIZ, W, J. da S., LIMA, A. O. de, REECY, J. M., MOURÃO, G. B., ZERLOTINI NETO, A., REGITANO, L. C. de A.
Published 2018-12-20

Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle.

by SOUZA, M. M., ZERLOTINI NETO, A., TIZIOTO, P. C., OLIVEIRA, P. S. N., SOMAVILLA, A. L., MOKRY, F. B., CESAR, A. S. M., DINIZ, W. J. S., MUDADU, M. de A., NICIURA, S. C. M., COUTINHO, L. L., REGITANO, L. C. de A.
Published 2014-10-22

Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds.

by STAFUZZA, N. B., ZERLOTINI NETO, A., LOBO, F. P., YAMAGISHI, M. E. B., CHUD, T. C. S., CAETANO, A. R., MUNARI, D. P., GARRICK, D. J., MACHADO, M. A., MARTINS, M. F., CARVALHO, M. R., COLE, J. B., SILVA, M. V. G. B.
Published 2017-07-07

Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds.

by STAFUZZA, N. B., ZERLOTINI NETO, A., LOBO, F. P., YAMAGISHI, M. E. B., CHUD, T. C. S., CAETANO, A. R., MUNARI, D. P., GARRICK, D. J., MACHADO, M. A., MARTINS, M. F., CARVALHO, M. R., COLE, J. B., SILVA, M. V. G. B.
Published 2018-01-31

Genome-wide distribution of allele-specific expression in Nelore steers muscle.

by SOUZA, M. M. de, ZERLOTINI NETO, A., NICIURA, S. C. M., ROCHA, M. I. P., DINIZ, W. J., TIZIOTO, P. C., OLIVEIRA, P. S. N. de, LIMA, A. O., AFONSO, J., CESAR, A. S. M, COUTINHO, L. L., REGITANO, L. C. de A.
Published 2018-11-30

Next generation sequencing and de novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome.

by CINTRA, L. C., ZERLOTINI NETO, A., LOBO, F. P., GIACHETTO, P. F., FALCAO, P. R. K., SILVA, L. O. C. da, EGITO, A. A. do, SIQUEIRA, F., SILVA, N. M. A. da, PAIVA, S. R., YAMAGISHI, M. E. B., CAETANO, A. R.
Published 2014-01-17

Differential allele-specific expression revealed functional variants and candidate genes related to meat quality traits in B. indicus muscle.

by BRUSCADIN, J. J., CARDOSO, T. F., DINIZ, W. J. da S., SOUZA, M. M. de, AFONSO, J., VIEIRA, D., MALHEIROS, J. M., ANDRADE, B. G. N., PETRINI, J., FERRAZ, J. B. S., ZERLOTINI NETO, A., MOURÃO, G. B., COUTINHO, L. L., REGITANO, L. C. de A.
Published 2023-01-23

LDHB gene has allele-specific expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency.

by ROCHA, M. I. P., SOUZA, M. M. de, ZERLOTINI NETO, A., TIZIOTO, P. C., OLIVEIRA, P. S. N. de, LIMA, A. O. de, AFONSO, J., DINIZ, W. J. da S., BUSS, C. E., COUTINHO, L. L., REGITANO, L. C. de A., NICIURA, S. C. M.
Published 2017-09-15

Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds.

by STAFUZZA, N. B., ZERLOTINI NETO, A., LOBO, F. P., YAMAGISHI, M. E. B., CHUD, T. C. S., CAETANO, A. R., MUNARI, D. P., GARRICK, D. J., MACHADO, M. A., MARTINS, M. F., CARVALHO, M. R., COLE, J. B., SILVA, M. V. G. B. da
Published 2017-05-19

Differential allelic expression and co-expression revealed oxidative stress-dependent proteolysis as a key regulator of nelore beef tenderness.

by BRUSCADIN, J. J., CARDOSO, T. F., DINIZ, W. J. da S., SOUZA, M. M. de, AFONSO, J., VIEIRA, D. da S., MALHEIROS, J., ANDRADE, B. G., PETRINI, J., FERRAZ, J. B. S., ZERLOTINI NETO, A., MOURÃO, G., COUTINHO, L. L. L, REGITANO, L. C. de A.
Published 2023-11-01

Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes.

by TIZIOTO, P., COUTINHO, L. L., DECKER, J. E., SCHNABEL, R. D., ROSA, C. O., OLIVEIRA, P. S. N., SOUZA, M. M., MOURÃO, G. B., TULLIO, R. R., CHAVES, A. S., LANNA, D. P. D., ZERLOTINI NETO, A., MUDADU, M. A., TAYLOR, J. F., REGITANO, L. C. A.
Published 2016-01-21

Genetic regulators of mineral amount in Nelore cattle muscle predicted by a new co-expression and regulatory impact factor approach.

by AFONSO, J., FORTES, M. R. S., REVERTER, A., DINIZ, W. J. da S., CESAR, A. S. M., LIMA, A. O. de, PETRINI, J., SOUZA, M. de S., COUTINHO, L. L., MOURÃO, G. B., ZERLOTINI NETO, A., GROMBONI, C. F., NOGUEIRA, A. R. A., REGITANO, L. C. de A.
Published 2020-09-08

DNA methylation may affect beef tenderness through signal transduction in Bos indicus.

by SOUZA, M. M. de, NICIURA, S. C. M., ROCHA, M. I. P., PAN, Z., ZHOU, H., BRUSCADIN, J. J., DINIZ, W. J. da S., AFONSO, J., OLIVEIRA, P. S. N. de, MOURÃO, G. B., ZERLOTINI NETO, A., COUTINHO, L. L., KOLTES, J. E., REGITANO, L. C. de A.
Published 2022-06-20

Gene expression differences in Longissimus muscle of Nelore steers genetically divergent for residual feed intake.

by TIZIOTO, P. L., COUTINHO, L. L., OLIVEIRA, P. S. N., CESAR, A. S. M., DINIZ, W. J. S., LIMA, A. O., ROCHA, M. I., DECKER, J. E., SCHNABEL, R. D., MOURÃO, G. B., TULLIO, R. R., ZERLOTINI NETO, A., TAYLOR, J. F., REGITANO, L. C. de A.
Published 2017-08-02

Integration of different omics layers with SNP-SNP interaction networks associated with methane emission in nelore cattle.

by CARDOSO, T. F., BRUSCADIN, J. J., DINIZ, W. J. da S., BANERJEE, P., AFONSO, J., ANDRADE, B. G. N. B, MALHEIROS, J. M., ZERLOTINI NETO, A., VIEIRA, D. da S., FERNANDES, A. C., CESAR, A. S. M., MOURÃO, G. B., COUTINHO, L. L., REGITANO, L. C. de A.
Published 2023-11-06

Potential biomarkers for feed efficiency-related traits in nelore cattle identified by co-expression network and integrative genomics analyses.

by LIMA, A. O. de, KOLTES, J. E., DINIZ, W. J. S., OLIVEIRA, P. S. N. de, CESAR, A. S. M., TIZIOTO, P. L., AFONSO, J., SOUZA, M. de S., PETRINI, J., ROCHA, M. I. P., CARDOSO, T. F., ZERLOTINI NETO, A., COUTINHO, L. L., MOURÃO, G. B., REGITANO, L. C. de A.
Published 2020-08-14

Multi-omics approach reveals miR-SNPs affecting muscle fatty acids profile in Nelore cattle.

by CARDOSO, T. F., COUTINHO, L. L., BRUSCADIN, J. J., DINIZ, W. J. da S., PETRINI, J., ANDRADE, B. G. N., OLIVEIRA, P. S. N. de, POLETI, M. D., CESAR, A. S. M., SILVEIRA, J. C. DA, CHIARATTI, M. R., ZERLOTINI NETO, A., MOURÃO, G. B., REGITANO, L. C. de A.
Published 2021-05-04

Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes.

by TIZIOTO, P., COUTINHO, L. L., DECKER, J. E., SCHNABEL, R. D., ROSA, K. O., OLIVEIRA, P. S. N., SOUZA, M. M., MOURÃO, G. B., TULLIO, R. R., CHAVES, A. S., LANNA, D. P. D., ZERLOTINI NETO, A., MUDADU, M. de A., TAYLOR, J. F., REGITANO, L. C. de A.
Published 2015-11-26

Repressive epigenetic mechanisms, such as the H3K27me3 histone modification, were predicted to affect muscle gene expression and its mineral content in Nelore cattle.

by AFONSO, J., SHIM, W. J., BODEN, M., FORTES, M. R. S., DINIZ, W. J. da S., LIMA, A. O. de, ROCHA, M. I. P., CARDOSO, T. F., BRUSCADIN, J. J., GROMBONI, C. F., NOGUEIRA, A. R. A., MOURÃO, G. B., ZERLOTINI NETO, A., COUTINHO, L. L., REGITANO, L. C. de A.
Published 2023-02-09